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      石河子大學學報(自然科學版)

      2020, v.38(03) 291-298

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      小黑麥NAC轉錄因子基因TwNAC01克隆及生物信息學分析
      Cloning and bioinformatics of NAC transcription factor TwNAC01 gene from Triticale(×Triticosecale Wittmack)

      王萌;任麗彤;凌悅銘;谷海濤;孔廣超;

      摘要(Abstract):

      NAC(NAM、ATAF1/2、CUC2)是在調控植物發育、衰老、生物與非生物逆境以及激素反應等方面具有重要作用的一類轉錄因子。為探索六倍體小黑麥耐干旱機制,本研究以六倍體小黑麥為材料,利用快速擴增cDNA末端(RACE)與反轉錄·聚合酶鏈反應(RT-PCR)技術克隆到1條NAC轉錄因子cDNA全長,分析了其生物信息學特點,同時利用實時定量PCR技術分析其在干旱脅迫下的組織部位表達特點。結果表明,所克隆小黑麥基因ORF全長1 059 bp,編碼352個氨基酸。該基因預測蛋白中具有NAM亞家族保守的氨基酸序列,且其預測蛋白氨基酸序列與山羊草中的NAC轉錄因子氨基酸序列同源性高達90%以上。該基因預測蛋白屬親水性蛋白,無跨膜結構域與信號肽區域,二級結構包含45個α-螺旋,57個β-折疊和250個無規則卷曲。預測蛋白定位于細胞核內。在干旱脅迫下,該基因在開花后22 d的小黑麥幼粒和根部的表達量明顯高于莖和葉,且表達量顯著受干旱脅迫誘導?梢娝寺〉幕驗樾『邴淣AC轉錄因子,將其命名為TwNAC01(GenBank登錄號為MG736919),其在小黑麥抗旱應激反應中具有重要作用。小黑麥NAC轉錄因子基因TwNAC01的克隆對于揭示小黑麥的抗旱性機制以及小黑麥抗旱基因工程育種具有重要意義。

      關鍵詞(KeyWords): 小黑麥;NAC轉錄因子;TwNAC01;基因克隆;干旱脅迫;生物信息學分析

      Abstract:

      Keywords:

      基金項目(Foundation): 國家自然科學基金項目(31860376,31360333)

      作者(Author): 王萌;任麗彤;凌悅銘;谷海濤;孔廣超;

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      DOI:

      參考文獻(References):

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